Phần lớn đường biên xã Kim Đông được bao bọc bởi các tuyến đê Bình Minh 1 và đê Bình Minh 2 đã được bê tông kiên cố hóa. Xã Kim Đông có đường tỉnh lộ 481 xuyên dọc xã và đường đê hữu Đáy nối tới thị trấn Bình Minh và thị trấn Phát Diệm.

Bến xe Kim Đông nằm ở gần chợ đầu mối thủy sản Kim Đông và trụ sở ủy ban xã. Hiện tại bến xe khách Kim Đông đã có các tuyến đi Kim Sơn, thành phố Ninh Bình, Hà Nội...

Cảng biển Kim Sơn được xây dựng ở bờ hữu cửa Đáy, dài khoảng 5 km, vừa là cảng thủy sản vừa là khu neo đậu cho tàu tránh bão.